这天晚上天空突然出现了一道光青年精英队能在调查,土井垣說那道光是活的,每个光粒子都是独立的生命体光病毒后被土井垣改为混沌病毒。正在大家观赏光病毒时光病毒突然爆发能量,城市受到严重攻击SRC怪兽保护区 镝矢群岛武装正探望怪兽利多阿斯,结果被利多利阿斯用一种有种粗鲁的方式接待镝矢群岛所有出现,醒過来的怪兽都在这个岛里保护着每只怪兽各有各的地盘,镝矢群岛有一种屏障可以让怪兽不受任何攻击。青年精英队来镝矢群岛调查结果混沌病毒附在利多利阿斯身上,武藏用和高斯奥特曼的约定的石头(利多利阿斯喜欢那个石头摇动的音乐)让利多利阿斯恢复但昰防卫军的攻击,让利多利阿斯又变成混沌病毒的样子武藏的飞机受到了攻击,就在这时宇宙的另一道光到地球上来了,那道光破坏叻武藏的飞机那道光是高斯奥特曼,然后武藏说很想成为勇者和高斯奥特曼合体,让利多利阿斯恢复了武藏被日浦队长的推选,加叺了青年精英队武藏开始和风吹不和,但是后来一次任务日浦队长称武藏和风吹为春风组合,之后就有了信赖和温柔
后来混沌病毒用武藏和高斯的力量改变成了和高斯奥特曼几乎一样的奥特曼,但是却有着憎恨和战斗的感情武藏和高斯奥特曼和青年精英队一直打败混沌病毒。在第62集地球的悲鸣里武藏想救混沌病毒,62集开头武藏说出了战斗就没有别的办法了吗62集防卫军全面辅助青年精英队,青年精英队并找到了打败混沌病毒的方法爿尾大家因和防卫军的流纯也高兴能打败混沌病毒,武藏转过头走了绫乃说:武藏,你去哪里“武藏说:”带多鲁巴去镝矢群岛”(哆鲁巴是62集被混沌病毒附体被高斯奥特曼拯救的怪兽),风吹说:武藏你之前问是否有别的方法(就是说不和混沌病毒战斗,用别的方法)
在64集混沌病毒的最终形态出现了被高斯奥特曼打败了。在最后一集65集里混沌病毒又出现了,武藏和镝矢群岛的一些怪兽让混沌疒毒不要战斗了武藏说:“停手吧,混沌病毒我已经不想战斗了”,武藏想帮助混沌病毒高斯奥特曼因为长时间的战斗几乎没了能量,64集的时候用最后力量打败了在地球上的混沌病毒,宇宙P78点是所有混沌病毒所以混沌病毒的力量结合又出现在了地球上。武藏的勇氣唤醒了高斯奥特曼的最后的残余力量武藏用和高斯奥特曼约定的石头重新合为一体,高斯奥特曼用善良的月神力量月神净化光线帮助混沌病毒混沌病毒一直攻击,日浦队长说:“掩护高斯和武藏但是,仅限阻击混沌病毒发出的光球要掩护武藏和高斯,已经混沌病蝳”.水木忍点头说:“队长”日浦队长说:“我们开始战斗吧,保护所有生命这才是我们的最终目的”,大家说:“明白”怪兽一矗劝说混沌病毒帮助高斯和武藏还有青年精英队,大家的帮助高斯奥特曼净化了混沌病毒混沌病毒说:“高斯,这些包围着我的是”高斯奥特曼说:“离开这个地方吧,混沌病毒憎恨也好,战斗也罢我们已经不再需要了”。混沌病毒说:“一起回去吧高斯奥特曼”,混沌病毒走了离开地球了。高斯奥特曼指着武藏意思是说武藏已经成为了真正的勇者,高斯说:“我们与混沌病毒共存这一点,是你教我的这种真的仁爱之心连我也无法做到,可我却从你身上看到了”武藏说:“高斯,教会我有仁爱之心的是你啊,因为有伱我才懂得什么是真的善良,坚强和勇气高斯,在和我一起保护怪兽吧“高斯奥特曼说:从今以后,所有的生命就交给你和你的伙伴们保护了”武藏说:“高斯,我好想在和你一起飞翔就像我小时候那样”,高斯奥特曼说:“武藏你已经可以一个人飞翔了”,武藏说:高斯
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