6、通过编译方式安装spark 下载源码 解壓 使用maven编译源码
轻量级高速集群计算 针对大规模的数据处理快速通用的引擎。 比hadoop的MR的内存计算快100倍磁盘10倍 易于使用,可以使用java,scala,python,R语言
提供了80多个高级操作
由于我国特殊的网络环境有时候我们通过conda无法顺利下载和安装生信软件,我们必须还得熟悉传统的软件安装方式以备不时之需。
传统的软件安装方式包括:安装预编譯版本的软件和从源代码安装软件由于从源代码安装软件的编译过程非常缓慢,一般情况下优先安装预编译版本
# 选择Linux系统安装包,复淛链接地址wget下载
# 也可使用浏览器下载后,通过FileZilla上传到服务器
解压缩后在安装目录下的bin
文件夹下课看到可执行文件:
我们手动安装的预編译版本的软件,默认情况下是不会把可执行文件添加到系统的环境变量中去的每次我们执行程序时,都需要使用程序的绝对路径这樣就非常麻烦。我们可以手动添加到环境变量中:
# 使添加的环境变量立即生效
直接运行blastp程序可以顺利执行,安装成功!