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WinGX的晶体解析教程
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官方公共微信----> 如何使用WinGX程序分析
如何使用WinGX程序分析
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如何使用WinGX程序分析晶体结构&&&&目录&&&&&&&&一、结构解析的过程(一)空间群的确定(二)解初结构(三)结构精修1、结构精修2、检验精修完毕的参考标准3、精修时INS文件中的指令和意义4、CIF文件5、用WinGX生成键长键角表二、画图1、XP中的指令2、操作实例三、H键分析1、策略2、步骤3、实例四、芳香环间的相互作用1、作用模型2、判断芳香环间相互作用的步骤3、实例五、CIF格式&&&&&&&&1&&&&&&&& 如何使用WinGX程序分析晶体结构&&&&一、结构解析的过程WinGX程序平台集成了下列主要程序:1、确定空间群(XPREP)2、解初结构(SHELXS-97、SIR-92、SIR-97、SIR-2002)3、结构精修(SHELXL)&&&&S.hkl&&&&&&&&S.hklS.p4p&&&&&&&&Xprep&&&&&&&&Shelxl&&&&S.insS.hkl&&&&&&&&ShelxsSir&&&&&&&&S.res&&&&&&&&S.ins&&&&&&&&S.cifS.fcf&&&&&&&&Edit&&&&&&&&(一)空间群的确定将衍射实验得到.hkl和.p4p两个文件(名称应一致)拷入一个文件夹中。打开WinGX,从标题栏File命令中选择CHANGEPROJECT下的SelectNewProject,此时会出现一个对话框,添加上述的.hkl或.p4p文件。1)标题栏Data命令中选择Xprep,出现一个新的对话框,输入.hkl的文件名。2)出现Selectoption命令,默认[4]。3)出现Mean(I/sigma)代表平均信/噪比(该数值要求7,12~20之间比较好)和格子类型。默认格子类型即可。4)选择H:SearchforhigherMetricSymmetry,寻找更高的对称性。5)程序显示各种可能的晶系和格子类型。根据Rint值大小确定晶系和格子类型。6)选择S:Determineorinputspacegroup,测定或输入空间群。7)选择S:Determinespacegroup,测定空间群。8)程序提供可能的晶系选择,认同程序的选择即可。9)程序列出所选晶系下的可能晶格类型。&&&&2&&&&&&&& 10)选定晶格类型后,程序将列出各种可能的空间群。11)选定空间群后,程序提示下一选项:Defineunit-cellCONTENTS(给出化合物的组成)。12)输入分子式(元素要大写如C8H9N6O7Cu1,注意中间要用空格)。13)提示下一个选项[E]:EXITtomainmenu。14)确认后,提示下一个选项[F]:SetupshelxtlFILES。15)确认后,提示输入结构名称(如S)。16)输入结构名称后,屏幕上会给出S.INS文件内容,并提问DoyouwishtowritetheintensitydatafileS.hkl?17)缺省值是No,应键入Y。18)提示下一个选项[Q]:QuitProgram。确认后退出Xprep程序。(二)解初结构1、确定初步的结构模型用直接法或帕特森法解决相角问题,找出部分原子或重原子的位置。直接法一般适用于有机分子和配合物。帕特森法尤其适用于独立单元中含有少数几个重原子的化合物。2、操作程序:1)从标题栏File命令中选择CHANGEPROJECT下的SwitchProjectID出现一个小对话框,输入上面第8步取的文件名(如上的S)。2)从标题栏Solve命令选择SHELXS-97/SIR-92/SIR-97/SIR-2002任意一个来解析结构。得出结构后,Exit退出该程序。3)解初结构的S.INS文件的格式&&&&TITLc2cinC2/cCELL0.0ZERR2.000.0015LATT7SYMM-X,Y,0.5-ZSFACCHNOCU&&&&&&&&9.&&&&&&&&7.105...&&&&&&&&3&&&&&&&& UNITTREF(PATT)HKLF4END&&&&&&&&LATT晶格种类:1表示简单格子P;2表示体心格子I;3表示菱面体格子;4表示面心格子;5表示A心格子;6表示B心格子;7表示C心格子。对于非中心对称空间群,n为负值;对于中心对称空间群,n为正值(三)结构精修1、结构精修1)点击“圆规”图标,显示初结构。①选中结构图中不确定的原子,从标题栏Delete命令中选择SelectedAtoms,删除这些原子。②选中元素类别指认错误的原子,按右键,弹出对话框,修改原子名称和元素种类③保存为INS文件后,再从标题栏Refinement命令中选择RunSHELXL进行精修。2)在新产生的Q峰中,将可指认的Q峰选中(如Q1、Q2…等),按右键,弹出对话框。按顺序输入原子名称和种类。保存为INS文件后,再进行精修。3)反复进行第二步,运算至结构模型收敛后,再加各向异性,在标题栏中Select命令下选择AllAtoms,按右键,选择SetUij`sanisotropic命令。保存为INS文件后,再进行精修。4)使处于割裂状态的有机分子连在一起若独立区中出现两个不完整的分子片段,而实际上这两个分子片段应该连在一起,则应将其搬到一起。①首先判断两片段是否连在一起在XP中读入RES文件后》enviC5(查看片段中断开位置的环境)[ent]C4-----C10-----(若为C5则自身对称无需搬移,否则要搬移)②》sgen片段的另一半原子[ent]&&&&4&&&&&&&& 》kill删掉原先的另一半原子[ent]》fileY22.res[ent]产生新的RES文件。在WinGX中将新的RES文件另存为INS文,并修改相应的原子名称后,重新精修即可。5)连续分子片段的质心应处在晶胞内晶体结构解析中,连续分子片段的质心应处在晶胞内,若处在晶胞之外,可通过下列操作,将其移入晶胞内。①等效点间的对称变换②平移操作。6)将原子重新排序命名,并用SORT命令使原子按顺序排列。保存为INS文件后,重新编辑INS文件,将金属原子排在最前面,再进行精修。7)理论加氢:选中该碳原子,从标题栏中Model命令选择AddHydrogen中与之相应的氢,保存为INS文件后,再进行精修。8)对于水或氮上的氢,采用差傅里叶图找氢,通过在INS文件中增加PLAN的数值,增加Q峰数,寻找位置合适的氢原子。9)氢原子指定后,需进行固定。①固定键长,在INS中加命令“DFIX0.900.01Ow1h1aOw1h1b”,固定O—H距离。②在INS中将H原子温度因子改为-1.5,并始终将H原子排在其母原子后面,中间不要插入其它非氢原子。10)由于每次精修完毕后,将RES文件存为INS文件时,程序会自动将所有从差傅里叶图找到的氢原子排在原子列表的最后面,从而导致H原子不能直接排在其母原子后面,这时需重新排列这些氢原子的位置。为了避免这种情况,可用MOLE命令将氢原子始终绑定在其母子后面。做法如下:把O和H的数据按如下顺序排列好O1----------H1----------Ow1----------H1A----------H1B----------Ow2----------H2A----------H2B-----------&&&&&&&&-----------------&&&&&&&&在O1前打mole1(即把O1与H1绑定)在OW1前打mole2(即把OW1与H1A,H1B绑定)&&&&5&&&&&&&& 在OW2前打mole3(即把OW2与H2A,H2B绑定)值得注意的是,此时不能再用SORT命令否则上述绑定无效。11)检查所有原子是不是已找完,查看Q峰(Q1时,认为非氢原子已找完)。12)独立区内电荷要平衡(如果不平衡,要找出合理的化学或晶体学解释)13)将INS文件中的X射线波长(0.784)值和晶胞中的各类原、Z子数目改为正确值,删除OMIT4.0180.0和LIST1两条命令,并加入ACTA、SIZE、CONF和BOND$H三条命令。14)结构全部解完后,若wR2值、GOOF(S)值仍不满意,可作如下处理:①删坏点:从标题栏Edit命令中选择OpenSHELXL.LST。若MostDisagreeableReflections中有个别Delta(F*2)/esd反常偏大的衍射。可在INS中删除这些衍射,输入命令“omithkl”。②改变权重因子:修改INS文件中的WGHT值。2、检验精修完毕的参考标准1)化学合理所有的键长,键角合理,电荷平衡2)CIF文件检测中发现的问题不论大小,应尽可能全部解决。3)晶体学合理①Rint值10%;Rsigma值10%。②R1(alldata)8%~9%;R1(obsdata)5%;wR220%;GOOF(S)接近1(±0.2)。③Maximumshift/esd收敛因子0.1(一般接近于0)④Highestpeak△ρmax1.0,Deepesthole△ρmin-1.0⑤是否存在实际上可连为一体,但目前处于割裂状态的有机分子?⑥独立区的质心是否处于晶胞内?⑦晶体的Z值是否正确?晶胞内原子数是否正确?电荷是否平衡?⑧数据完整度是否达到97%?⑨衍射数据与精修参数比要大于7。⑩绝对结构是否正确?是否是孪晶?3、精修时INS文件中的指令和意义&&&&TITLccinCcCELL0.019.0ZERR2.000..0031LATT-7SYMMX,-Y,1/2+ZSFACCHNONIUNIT&&&&&&&&90.&&&&&&&&97.7270.05&&&&&&&&90.&&&&&&&&6&&&&&&&& MERG2DFIX0.900.01ow1h1aow1h1bFMAP2PLAN5ACTA50.00SIZE0.320.140.11BOND$HCONFWGHT0.01920L.S.4FVAR0.1.910.090.500.00561…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….………………………………………………………………………………………..OW140.1.470.44-0.380.00383HKLF4END&&&&&&&&4、CIF文件CIF文件是晶体结构数据的标准格式。在INS文件中加上指令“ACTA”,就会在精修之后产生相应的CIF文件。&&&&&&&&5、用WinGX生成键长键角表在WinGX的标题框中Publish命令中选择CIFTABLES,出现一新的对话框,选择Crystal/atomtablesform.CIF命令,确定。其它均选默认格式,最终得到--.Tex文件,可用Word编辑此文件。注意:1)生成的键长、键角表中的两个有对称性相关的等价数值如Cu1—N1#1,N1—Cu1#1只留一个数据。2)由对称性产生的键角N1#1—Cu—N1夹角(如180?),应该删掉。3)误差只保留1位有效数字,如2.137(12)应为2.14(1)。二、画图1、XP中的指令readREADfilecode读入指定文件中的原子和晶体参数。fmol从code.res文件读出原子坐标等信息,并建立起原子间的连接方式。proj显示分子的结构,可以选择旋转分子的立体结构。kill除所指定的原子,如kill$Q(删除所有Q峰),killC1toC2。lablLABLcodesize将定义如何标注原子和标注字体的大小。&&&&7&&&&&&&& telpTELP[ent]将产生球棍图,TELP0–30[ent](概率为30%)。viewVIEWplotfile显示保存的图形文件draw将文件转换成其它格式2、操作实例输入以下命令:》readxx.res[ent]》fmolall[ent]》proj(看分子图形)》killtype2[ent](去掉所有H原子)》killow2[ent](去掉水)》labl1400[ent](定义大小)》telpall[ent]出现plotfile命令,命名》view命名(查看刚刚画的图)》draw名称出现提示:SLPTdevice默认为A模式,[ent]出现提示:Nameofpostscriptfiletobecreated:重新命名出现提示:Color(C)orblack/white(CR)选择颜色,彩色C[ent],黑白直接[ent]。得到结构的圆球图。用AdobePhotoshop打开—.ps文件即可看到。若想得到椭球图,将》telpall命令改为telp0–30即可。三、H键分析&&&&&&&&1、策略&&&&&&&&X&&&&&&&&H&&&&&&&&Y&&&&&&&&1)X代表给体原子,通常为O、N和F,有时还包括C。其中X=O、N和F时,是经典的氢键;X=C时属于非经典氢键,此时氢键作用力比较小。2)Y代表受体原子,通常包括O、N、F和Cl。3)通常要求X-H…Y的夹角α110°,理论上这个角度最理想时应为180°4)对于O-H…O氢键,O…O的距离一般是2.6-3.3?;5)分子内与分子间氢键:分子内氢键(X、H、Y都在独立区内)分子间氢键(X、H在一独立区内;Y在另一独立区)&&&&&&&&2、步骤&&&&1)确定给体X有哪些原子,分别列出;2)在XP中,用ENVI命令经运算,找到所有可能的受体,并记录下来以备后用(一般选择距离在2.6-3.3?之内的受体)。&&&&8&&&&&&&& 3)在XP中,找上述所有可能受体的对称代码(其中1555为独立区内的)。4)打开INS,将这些对称代码按格式输入(EQIV),并添加氢键计算命令(HTAB),进行精修运算。程序会指出哪些氢键的角度不合理,打开INS文件,删掉不合理氢键的计算命令,重新精修。&&&&&&&&3、实例&&&&相关指令意义:ENVIdeltaKEYWORDS计算出KEYWORDS所指定原子与在其半径加上delta值范围内所有原子的距离。sgenSGENsymcodeKEYWORDS根据对称代码产生新的原子,对称性代码可以通过ENVI指令找出,如sgen6555O1[ent]将产生O1原子在6555对称代码处的原子O1A。info显示所有原子坐标信息。envi步骤一(在XP中,输入给体受体的距离命令经程序运算,找到可能的受体。)⑴XP中》readc2c.res》fmolall》proj》enviO12.5(找出可作为O1受体的所有原子)………………….………………….NOW备注:看到N1和OW2符合距离要求。记录下来:O1---H---N1(1555)O1---H---Ow2(1555)同理》enviOw12.5(找出可作为O1受体的所有原子)N记录OW1—H---N2(2555)步骤二(在XP中,找各上述所有可能受体的对称代码)》sgen2555Ag1(求出对称代码为2555的Ag1原子坐标)》info(与原始Ag1原子坐标比较,得到对称代码的坐标变换关系)(2555)→X+0.5,Y+0.5,Z》sgen3776Ag1(求出对称代码为3776的Ag1原子坐标)(与原始Ag1原子坐标比较,得到对称代码的坐标变换关系)》info(3776)→2-X,1+Y,0.5-Z&&&&9&&&&&&&& ………………………………在INS中键入下列命令行:Eqiv$1X+0.5,Y+0.5,ZEqiv$22-X,1+Y,0.5-ZEqiv$32-X,1+Y,0.5-Z………………………………Htab
O1N1HtabO1OW2HtabOW1O2$1HtabOW1O2$2…………………保存INS文件后,重新精修。精修完毕后,会警告角度在100°以下的不合理氢键:O1N1OW1O3$1…………………….在INS中将计算这些氢键的HTAB命令删掉,重新精修。H键计算结果在CIF中的格式:O1H11OW20.849(10)↓D-H距离1.8(4)↓H-A距离2.617(14)↓D-A距离169(16)↓角度&&&&&&&&…&&&&&&&&…&&&&&&&&最后得出结论独立区内氢键:O1-H11-OW2独立区间氢键:OW1-H1A-O4OW1-H1B-O2…………………………..四、芳香环间的相互作用1、作用模型&&&&&&&&10&&&&&&&& ls&&&&&&&&d&&&&&&&&d——平面间距离,也就是一个苯环的质心到另一个&&&&苯环所处平均平面的距离。&&&&&&&&l——两个苯环质心间的距离s——两个苯环的滑程&&&&2、判断芳香环间相互作用的步骤1)找出有可能与所研究芳香环存在相互作用的所有其它芳香环。A、在XP中,找出独立区内所有芳香环的质心位置。B、若其它芳香环质心与所研究芳香环质心距离l4.6?,则芳香环间可能存在相互作用。2)在l4.6?的情况下,计算其它芳香环质心与所研究芳香环所处平面的距离d。若d3.9?,则芳香环间可能存在相互作用。3)在l4.6?,且d3.9?的情况下,计算其它芳香环与所研究芳香环的滑程s。若s2.1?,则芳香环间确实存在相互作用。&&&&&&&&滑程Slippages=(l-d)&&&&&&&&2&&&&&&&&21/2&&&&&&&&4)在l4.2?,d3.9?,s2.1?的情况下,若两个芳香环所处平面的夹角小于20度,则两芳香环间的作用为π-π堆积;若大于20度,则为C-H…π作用。5)描述两芳香环间的作用时,应提供d值、值,s并指明是π-π堆积,还是C-H…π作用。3、实例1)相关指令意义:cent计算并显示所指定原子的中心位置,如,centC1toC5将计算这5个原子的中心点坐标。mplnMPLNKEYWORDS计算所指定原子所形成的最小二乘平面,并计算该平面与先前用MPLN或LINE指令所计算的平面的法线或矢量所形成的夹角。2)操作过程:在XP中》read_.res》fmolall》proj》cent/xc1c2c3c4c5n1&&&&&&&&苯环上的原子(生成x1a质心)&&&&11&&&&&&&& 》cent/xc4c5c6c7c8c9另一个苯环上的原子(生成x1b质心)》proj(看一下质心位置)》envix1a4.0(找出到x1a距离4.6内的共有几个质心)》sgen3776x1a(生成到x1a距离4.6内的质心)》sgenb(生成到x1a距离4.6内的质心)》mplnc1c2c3c4c5n1(看质心到平面间的距离)若质心到平面间的距离小于3.9,则进一步计算滑程。》envix1b4.0(找出到x1b距离4.6内的共有几个质心)》sgenb(生成到x1b距离4.6内的质心)》……》quit五、CIF格式将CIF文件用记事本打开&&&&&&&&data_p2c_audit_creation_method_chemical_name_?;_chemical_name_common_chemical_melting_point_chemical_formula_moiety_chemical_formula_sumC35H46Co3N4O12_chemical_formula_weight&&&&&&&&SHELXL-97(产生CIF的程序名称)(系统命名法)&&&&&&&&&&&&&&&&?(俗名)(熔点)(化学式)891.55(分子量)&&&&&&&&loop__atom_type_symbol_atom_type_description_atom_type_scat_dispersion_real_atom_type_scat_dispersion_imag_atom_type_scat_source(以下为衍射因子的来源)CC0.InternationalTablesVolCTables4.2.6.8and6.1.1.4HH0.…_symmetry_cell_setting?(晶系名称)_symmetry_space_group_name_H-M?(空间群名称)loop__symmetry_equiv_pos_as_xyzx,y,z-x,y+1/2,-z+1/2-x,-y,-zx,-y-1/2,z-1/2(以下为晶胞参数)_cell_length_a_cell_length_b_cell_length_c_cell_angle_alpha_cell_angle_beta_cell_angle_gamma_cell_volume_cell_formula_units_Z_cell_measurement_temperature_cell_measurement_reflns_used_cell_measurement_theta_min(晶胞中等效点空间坐标)&&&&&&&&10.122(5)13.407(5)26.346(5)90.000(5)97.217(5)90.000(5)3(2)&&&&&&&&(晶胞中分子数)(确定晶胞时衍射实验的温度)(确定晶胞时所用衍射点的数量)(确定晶胞时衍射点的最小θ值)&&&&12&&&&&&&& _cell_measurement_theta_max&&&&&&&&?&&&&&&&&(确定晶胞时衍射点的最大θ值)(衍射实验晶体的形状)(衍射实验晶体的颜色)(衍射实验晶体的尺寸)(晶体的测量密度)(衍射实验计算得到的晶体密度)(测量晶体密度的方法)(晶胞内电子的数目)(晶体对X射线吸收系数)(吸收校正的方法)(最小透过率)(最大透过率)(吸收校正所用程序的参考文献)(实验中的特殊情况)&&&&&&&&_exptl_crystal_description?_exptl_crystal_colour?_exptl_crystal_size_max?_exptl_crystal_size_mid?_exptl_crystal_size_min?_exptl_crystal_density_meas?_exptl_crystal_density_diffrn1.670_exptl_crystal_density_methodnotmeasured_exptl_crystal_F_0001844_exptl_absorpt_coefficient_mu1.458_exptl_absorpt_correction_type?_exptl_absorpt_correction_T_min?_exptl_absorpt_correction_T_max?_exptl_absorpt_process_details?_exptl_special_?;_diffrn_ambient_temperature_diffrn_radiation_wavelength_diffrn_radiation_type_diffrn_radiation_source_diffrn_radiation_monochromator_diffrn_measurement_device_type_diffrn_measurement_method_diffrn_detector_area_resol_mean_diffrn_standards_number_diffrn_standards_interval_count_diffrn_standards_interval_time_diffrn_standards_decay_%_diffrn_reflns_number_diffrn_reflns_av_R_equivalents_diffrn_reflns_av_sigmaI/netI_diffrn_reflns_limit_h_min_diffrn_reflns_limit_h_max_diffrn_reflns_limit_k_min_diffrn_reflns_limit_k_max_diffrn_reflns_limit_l_min_diffrn_reflns_limit_l_max_diffrn_reflns_theta_min_diffrn_reflns_theta_max_reflns_number_total_reflns_number_gt_reflns_threshold_expression_computing_data_collection_computing_cell_refinement_computing_data_reduction_computing_structure_solution_computing_structure_refinement_computing_molecular_graphics_computing_publication_material&&&&&&&&293(2)(衍射实验温度)0.71069(衍射波长)MoK\a(衍射光源)fine-focussealedtube(放射源)graphite(用的单色器)?(衍射仪的名称)?(扫描方式)?()?(标准衍射的数量)?(标准衍射测量的间隔)?(标准衍射测量的时间间隔)?(测量过程中是否衰减)17622(总衍射数目)0.0523(等效点平均标准误差)0.0619(平均背景强度与平均衍射强度比值)-9(最小和最大衍射指标)12-.56(最小θ角)25.00(最大θ角)6221(参加精修的独立衍射数目)4370(强度大于2σ的衍射数目)2sigma(I)SHELXL-97(Sheldrick,1997)&&&&&&&&_refine_ls_structure_factor_coefFsqd(基于F*F的精修)_refine_ls_matrix_typefull(精修矩阵类型)_refine_ls_weighting_schemecalc(权重方案)_refine_ls_weighting_detailscalcw=1/[\s^2^(Fo^2^)+(0.0658P)^2^+0.1795P]whereP=(Fo^2^+2Fc^2^)/3_atom_sites_solution_primarydirect(获得粗结构的方法)_atom_sites_solution_secondarydifmap(进一步就解析结构的方法)_atom_sites_solution_hydrogensgeom.(获得氢原子的方法)_refine_ls_hydrogen_treatmentmixed(精修中氢原子的处理方案)_refine_ls_extinction_methodnone_refine_ls_extinction_coef?_refine_ls_number_reflns6221(参加精修独立衍射点数目)_refine_ls_number_parameters490(参数数目)&&&&13&&&&&&&& _refine_ls_number_restraints2(几何限制参数数目)_refine_ls_R_factor_all0.0748(对于全部衍射点的R1值)_refine_ls_R_factor_gt0.0489(对于可观测衍射点的R1值)_refine_ls_wR_factor_ref0.1374(对于全部衍射点的wR2值)_refine_ls_wR_factor_gt0.1226(对于可观测衍射点的wR2值)_refine_ls_goodness_of_fit_ref1.072(对于可观测衍射点的S值)_refine_ls_restrained_S_all1.083(对与全部衍射点的S值)_refine_ls_shift/su_max0.001(最后精修过程中的最大移动值)_refine_ls_shift/su_mean0.000(最后精修过程中的平均移动值)loop__atom_site_label_atom_site_type_symbol_atom_site_fract_x_atom_site_fract_y_atom_site_fract_z_atom_site_U_iso_or_equiv_atom_site_adp_type_atom_site_occupancy_atom_site_symmetry_multiplicity_atom_site_calc_flag_atom_site_refinement_flags_atom_site_disorder_assembly_atom_site_disorder_groupCo1Co0....02368(18)Uani11d...(以上为原子坐标,各向同性振动参数,原子占有率等)loop__atom_site_aniso_label_atom_site_aniso_U_11_atom_site_aniso_U_22_atom_site_aniso_U_33_atom_site_aniso_U_23_atom_site_aniso_U_13_atom_site_aniso_U_12Co10.......023(2)0.047(2)0.053(2)0...0039(15)...(以上为原子各向异性振动参数)_geom_special_Allesds(excepttheesdinthedihedralanglebetweentwol.s.planes)areestimatedusingthefullcovariancematrix.Thecellesdsaretakenintoaccountindividuallyintheestimationofesdsindistances,ancorrelationsbetweenesdsincellparametersareonlyusedwhentheyaredefinedbycrystalsymmetry.Anapproximate(isotropic)treatmentofcellesdsisusedforestimatingesdsinvolvingl.s.planes.;(以上为分子几何中要说明的问题)loop__geom_bond_atom_site_label_1_geom_bond_atom_site_label_2_geom_bond_distance_geom_bond_site_symmetry_2_geom_bond_publ_flagCo1O12.064(3).?Co1O22.064(3).?...(以上为键长数据以及对称代码。“yes”表示要列入精选键长,键角表,带“?”的不发表)loop__geom_angle_atom_site_label_1_geom_angle_atom_site_label_2_geom_angle_atom_site_label_3_geom_angle_geom_angle_site_symmetry_1_geom_angle_site_symmetry_3_geom_angle_publ_flagO1Co1O283.00(12)..?O7Co2O)..?...&&&&14&&&&&&&& (以上为键角数据以及对称转换代码。“yes”表示要列入精选键长,键角表,带“?”的不发表)_diffrn_measured_fraction_theta_max_diffrn_reflns_theta_full_diffrn_measured_fraction_theta_full_refine_diff_density_max1.(对于最大θ角,收集的完整率)25.00(精修中使用的θ角为25度)0.998(θ角为25度时,数据的完整程度)(?F图中最大电子密度峰值)&&&&&&&&······························································Flackxparameter=0.0193withesd0.0094Expectedvaluesare0(within3esds)forcorrectand+1forinvertedabsolutestructure.Notethatthisroughestimateignorescorrelatioiftheabovevaluedifferssignificantlyfromzero,itisESSENTIALtotesttheinvertedstructureorrefinexasafull-matrixparameterusingTWINandBASF。&&&&&&&&15&&&&&&&&
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WinGX使用方法实例初解
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