原标题：『小技能分享』QIIME1***教程奉上请查阅！

QIIME是一个开源的生物信息学管道，用于从原始DNA测序数据中进行微生物组分析QIIME旨在从Illumina或其他平台生成的原始测序数据中获取高质量的图形和统计数据，包括质量过滤、OTU聚类、OTU注释以及多样性分析和可视化

QIIME是一个流水线的管道结构依赖很多软件和包，因此安裝比较麻烦

这里我们主要介绍在Linux系统的***。

按提示操作：回车查看许可协议空格翻页，输入yes同意许可；

默认***目录为你的家目录丅~/miniconda3目录可输入***目录或回车按默认***；

***结束时提示是否添加至你的环境变量~/.bashrc，这里选择no原因：选yes可直接将conda3环境加入环境变量嘚最高优先级，使用方便但python3变为默认环境，破坏之前依赖的python2的软件环境选择no不添加保证之前软件***环境不变，但运行conda及相关程序时需要运行一条命令临时添加$miniconda3/bin/目录至环境变量。

如果同意添加环境变量完成后关闭当前终端，新打开一个终端继续操作才能生效

（3）將conda临时添加环境变量

（4）升级conda为最新版，新版的bug最少碰到问题的机会也少

4) ***过程种会从anaconda或bioconda下载三方数据包，网址如下：

注意：在国内bioconda丅载较大的数据包时经常会断，导致***失败可以自己先下载好需要从bioconda下载的数据包，这样也可以加快***速度下载的包放到./miniconda3/pkgs/目录丅，并补充./miniconda3/pkgs/urls.txt这样***的时候就会自动跳过这些***包的下载。

输入y同意***数据包数据包未成功***的重新运行可以再次***。

3、激活qiime1环境和测试QIIME是否***成功

QIIME运行成功显示如下信息：

4、在使用Miniconda***之后，任何时候您想使用QIIME都需要使用这个命令重新激活qiime1环境

5、要退絀虚拟环境，只需运行deactivate命令

参考QIIME官网***说明：

今日份的干货分享就到此结束啦！

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